طراحی و مدلبندی آنتی بادی scfv انسانی شده علیه htnf-? و بررسی اینتراکشن آنها
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید مدنی آذربایجان - دانشکده علوم پایه
- نویسنده آیدا بقال صفری زاد
- استاد راهنما مریم حمزه میوه رود داود فرج زاده سیاوش دستمالچی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1392
چکیده
tnf-? یک سایتوکاین پیش التهابی است که اساسا بوسیله ماکروفاژهای تحریک شده ترشح می شود تا سیستم های کنترلی درگیر در تکثیر سلولی، تمایززدایی، التهاب، مرگ و تنظیم ایمنی را فعال کند. گرچه سطح طبیعی tnf-? برای تنظیم پاسخ های ایمنی بسیار مهم است، اما افزایش سطح آن باعث التهاب های مزمن، بیماری های خودایمنی و عفونت می شود. بنابراین هدف قرار دادن tnf-? با استفاده از آنتی بادی ها می تواند یک استراتژی درمانی موثر در کنترل و درمان چنین بیماری هایی باشد. از سویی اغلب آنتی بادی های موجود علیه tnf دارای عوارض جانبی گسترده ای می باشند که پروسه ی درمان را با مشکل مواجه می کند، از این رو نیاز به طراحی و تولید آنتی بادی های جدید با کارایی بالاتر و عوارض جانبی کمتر ضروری به نظر می رسد. قبل از تولید یک ترکیب دارویی جدید، در ابتدا باید ساختار آن طراحی گردیده و فعالیت و عملکرد بیولوژیکی آن ارزیابی گردد. عملکرد-های بیولوژیکی ماکرومولکول ها مثل پروتئین ها اساسا توسط ساختار مولکولی آنها تعیین می شود. روش های تجربی مختلف مثل کریستالوگرافی اشعه x و رزونانس مغناطیس هسته ای(nmr) ، برای توصیف و درک جزئیات اطلاعات ساختاری در سطح اتمی مورد استفاده قرار می گیرد، اما استفاده از روش های فوق جهت بدست آوردن اطلاعات ساختمانی بیوماکرومولکول ها بسیار مشکل و مستلزم هزینه های گزاف است .امروزه روش های محاسباتی مدلبندی مولکولی جهت پیش بینی و طراحی ساختار سه بعدی ماکرومولکول ها بسیار مناسب بوده و اخیرا بسیار مورد توجه قرار گرفته است. شبیه سازی مولکولی پروتئین ها و کمپلکس های پروتئین-پروتئین، اطلاعات مفیدی در مورد ساختار و برهمکنش های احتمالی ماکرومولکول ها بدست می دهد. هدف از این مطالعه ، پیش بینی ساختار سه بعدی برای کمپلکس های ایجاد شده بین tnf-? و آنتی بادی تک زنجیره ای hd2 می باشد. هدف کلی این کار طراحی و مدلبندی یک آنتی بادی تک زنجیره(scfv) انسانی شده علیه htnf-? و بررسی اینتراکشن آنهاست.مطالعه ی حاضر نشان داد که از بین مدل های ایجاد شده یرای آنتی بادی hd2 توسط الگو های مختلف، مدلی که براساس الگوی توالی پروتئینی مربوط به 2ghw ایجاد شده، بهترین انطباق را از لحاظ برهمکنش با نقاط اساسی و مهم در tnf-?(اسیدآمینه های مناطق 141-148) نشان می دهد. همچنین نتایج ala-scanning نشان داد جهش در هر کدام از اسیدآمینه های مهم hd2 در برهمکنش با tnf-? باعث بهبود ساختار کمپلکس tnf-?- hd2نشد. همچنین جهش زایی به اسیدآمینه هایی به غیر از آلانین نشان داد که فقط تبدیلf y27 باعث کاهش انرژی آزاد و افزایش پایداری ساختمان کمپلکس hd2-tnf-? می گردد.
منابع مشابه
ساخت کتابخانه ژنی آنتی بادی scfv انسانی بر پایه t vector علیه توکسین کزاز
سابقه و هدف: امروزه آنتی بادی ها در حوزه های تشخیص و درمان جایگاه ویژه ای را به خود اختصاص داده اند. در این میان، آنتی بادی های مونوکلونال کاملاً انسانی به دلیل عدم برانگیختن پاسخ ایمنی در بدن و کارایی بالا در درمان بیماری ها مورد توجه قرار گرفته اند. تحقیق پیش رو به منظور ساخت کتابخانه ژنی آنتی بادی نوترکیب انسانی از یک فرد واکسینه با توکسوئید کزاز انجام گرفته است. مواد و روش ها: ابتدا از فرد ا...
متن کاملجداسازی قطعات مناطق متغیر آنتی بادی تک زنجیره ای (scFv) علیه فاکتور نکروز دهنده تومور آلفا (TNF-?) از کتابخانه آنتی بادی فاژی
خلاصهسابقه و هدف: سایتوکاین تراپی، یکی از راهکارهای اصلی برای کنترل بیماری های التهابی شدید است. با توجه به اهمیت TNF-? در بسیاری از بیماری های التهابی و اتو ایمیون، این سایتوکاین یک هدف جذاب برای بسیاری از محققین بوده و بعنوان یکی از کاندیدهای مهم برای سایتوکاین تراپی مطرح است. یکی از راهکارهای مقابله با آثار زیانبار TNF-? استفاده از آنتی بادی های مونوکلونال است. یکی از تکنیک های مهم برای ت...
متن کاملجداسازی و بررسی خصوصیات مولکول هایscFv ضد HER2 با استفاده از تکنولوژی نمایش فاژی جهت تشخیص سرطان پستان
مقدمه: scFv ها، فرم هایی از آنتی بادی های نوترکیب می باشند که با استفاده از روش های پیشرفته بیولوژی مولکولی و مهندسی ژنتیک ساخته می شوند. همچنین آنتی ژن HER2 هدف مناسبی برای طیف گسترده ای از سرطان ها می باشد. مطالعه حاضر با هدف جداسازی scFv آنتی بادی های اختصاصی انجام شد. روش‌کار: به منظور جداسازی قطعات scFv های اختصاصی علیه قسمت خارج سلولی HER2 کوت شده در ایمونوتیوب، تکنولوژی نمایش فاژی با است...
متن کاملکلونینگ و بیان scfv آنتی بادی منوکلونال موشی ضد پلاسمینوژن انسانی و بررسی فعالیت فیبرینولیتیک آن
امروزه آنتی بادی های منوکلونال از پر مصرف ترین داروهای بیولوژیک هستند. اولین گام در این راستا ساخت قطعات آنتی بادی (scfv) است که مزیت آن در داشتن اندازه کوچک، پاکسازی (کلیرانس) سریع از خون و نفوذپذیری بهتر به بافت ها است. آنتی بادی منوکلونال a1d12 که سبب افزایش هضم لخته به مقدار 50-3 برابر در حضور فعال کنندگان پلاسمینوژن می شود، کاندید خوبی به عنوان دارو در بیماران مبتلا به انسداد رگی است. بناب...
15 صفحه اولطراحی کیت سنجش آنتی ژن P24 ویروس HIV با استفاده از آنتی بادی منوکلونال انسانی
سابقه و هدف: چندین روز پس از عفونت با ویروس HIV و قبل از تغییرات سرمی در مرحله وجود RNA ویروس در خون، آنتی ژن p24 در خون قابل سنجش است. مطالعات نشان می دهد در مراحل اولیه عفونت آنتی ژن p24 بسیار زودتر از آنتی بادی بر علیه ویروس ظاهر می شود. بنابراین ارزیابی آنتی ژن p24 ویروس می تواند شاخص مناسبی برای تشخیص عفونت در مراحل اولیه بیماری باشد. هدف از این پژوهش استفاده از روش الایزا برای تش...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید مدنی آذربایجان - دانشکده علوم پایه
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023